Манастиру је шума одузета 1945. године без накнаде. Врање – Решењем Дирекције за реституцију, Епархији врањској, односно манастиру Свети Прохор Пчињски враћено је 750 хектара шуме на Козјаку одузете 1946. године. То је први случај да је Епархији врањској враћена имовина одузета после Другог светског рата.
Директор Дирекције за реституцију Владимир Тодоровић изјавио је агенцији Бета да је манастиру Свети Прохор Пчињски шума враћена на основу Закона о враћању имовине црквама и верским заједницама који је Скупштина Србије донела 2006. године.
Тим законом предвиђено је враћање покретне и непокретне имовине која је после 1945. године одлуком комунистичких власти одузета без накнаде. „Процедура је спроведена према закону и манастиру је правно и формално враћено 750 хектара шуме и шумског земљишта на Козјаку којима је до сада у име државе газдовало јавно предузеће Србијашуме. Овим је манастир добио сигурнију основу за опстанак и духовни развој“, казао је Тодоровић.
Он је навео да је Епархији врањској одузето око 1.000 хектара земљишта свих категорија, пољопривредног, грађевинског и шумског, као и да црквене власти потражују углавном пољопривредно и шумско земљиште.
Секретар Епархије врањске Владан Милутиновић изјавио је агенцији Бета да је поступак враћања шуме трајао више од годину дана, као и да је „тако брзом решењу допринело и велико разумевање од стране Србијашума“. „Епархија врањска потражује имовину манастира Свети Стефан у селу Горње Жапско и Свети Пантелејмон у Лепчињцу, у општини Врање, потом за манастир Свети пророк Илија у Кацапуну у општини Владичин Хан и један део земљишта у општини Босилеград“, казао је Милутиновић и додао да су процеси у току.